Antecedentes: La presencia de microorganismos en la vagina en circunstancias de colonización o infección, contribuye a la salud o al desarrollo de patologías infecciosas. Objetivo: Caracterizar los microorganismos de secreciones vaginales de pacientes de un laboratorio privado de Ciudad del Este, Paraguay, 2021-2022. Materiales y métodos: El estudio es cuantitativo, descriptivo y observacional, se estudiaron datos de 836 mujeres que se realizaron análisis de secreciones vaginales en el Laboratorio Laced entre los años de 2021 y 2022. Resultados: Se encontró un total de 972 microorganismos aislados, al cual 27,37% de Gardnerella vaginalis, 21,81% de Lactobacillus sp, 18,31 % de Candida sp, 16,67% Corynebacterium sp y, 13,58% de Enterococcus sp. La franja etaria con mayor aislamiento de Gardnerella vaginalis fue de 20-30 años con 37,34% (n= 99/266). Conclusión: Gardnerella vaginalis fue la bacteria frecuentemente aislada y podría causar vaginosis o vaginitis en las mujeres.